Cùng với nhiệm vụ huấn luyện sẵn sàng chiến đấu, bảo đảm tốt công tác phòng hoá cho toàn quân, Binh chủng Hoá học nói riêng và Lữ đoàn Phòng hoá 86 nói chung đã hoàn thành xuất sắc nhiệm vụ điều tra, thu gom, xử lý chất độc hoá học còn tồn lưu sau chiến tranh; ứng phó nhanh, xử lý hiệu quả các sự cố môi trường, hoá chất độc xạ. Nhiệm vụ nguy hiểm, độc hại nhưng trong suốt 40 năm qua, những người lính Phòng hoá 86 đã thầm lặng chiến đấu, góp phần trả lại môi trường sống an toàn cho người dân và phục vụ phát triển kinh tế xã hội của đất nước.