Nhiều năm qua, Công đoàn Tổng cục Hậu cần đã có những điểm nhấn quan trọng trong hoạt động, khẳng định vai trò, vị trí của tổ chức công đoàn trong Quân đội, điển hình là phong trào thi đua yêu nước được tổ chức sâu rộng, công đoàn tham gia quản lý doanh nghiệp, là đại diện bảo vệ quyền, lợi ích hợp pháp của đoàn viên, công nhân viên chức, lao động quốc phòng. Các hoạt động thi đua đã động viên đoàn viên tích cực lao động sản xuất với năng suất, chất lượng ngày càng tăng.