Sau hơn một năm ứng dụng tại Cửa khẩu quốc tế Hữu Nghị và cửa khẩu phụ Tân Thanh, tỉnh Lạng Sơn thì hiệu quả của Cửa khẩu số đã được khẳng định. Khác với việc kê khai trên giấy như trước thì nay, những thủ tục liên quan đến xuất nhập khẩu chỉ cần thực hiện trên những lần nhấp chuột. Còn ở nhiều cửa khẩu khác, thay vì mất từ 10 đến 15 phút như trước thì nay với sự hỗ trợ của công nghệ hiện đại, mỗi lượt người xuất nhập cảnh chỉ mất từ 2 đến 3 phút. Không chỉ giúp cho người dân, du khách và các doanh nghiệp tiết kiệm thời gian thông quan, xuất nhập khẩu hàng hóa, cửa khẩu số còn giúp bộ đội biên phòng kiểm soát quản lý các đối tượng cấm hoặc tạm hoãn xuất nhập cảnh.