Tại các chung cư đã đi vào hoạt động thì vấn đề mâu thuẫn gay gắt nhất giữa chủ đầu tư và cư dân chính là phí quản lý vận hành chung cư. Trong thời gian qua, tại Hà Nội đã xảy ra hàng hoạt tranh chấp giữa cư dân và chủ đầu tư liên quan đến vấn đề này như tại dự án Artemis nằm trên đường Lê Trọng Tấn, quận Thanh Xuân; và mới đây nhất là dự án Eco Lake View tại số 32 Đại Từ, quận Hoàng Mai do Công ty CP EcoLand làm chủ đầu tư. Theo các chuyên gia, nguyên nhân dẫn đến thực trạng trên là do luật còn nhiều lỗ hổng, trong khi nhiều chủ đầu tư làm ăn theo kiểu chộp giật lại lợi dụng kẽ hở này để o ép khách hàng.